隔年，谢玄北伐，成功收复黄河、秦岭以南地区。
之后，东晋内乱，桓玄篡位，谯蜀独立，疆域逐渐萎缩。
刘裕崛起后，攻灭谯蜀并发动两次北伐，收复蜀地、青兖、司豫及关中地区。
然而刘裕因故返京，将领内乱，夏人入侵，导致关中得而复失。
此时，东晋领有扬、北徐、豫、江、北青、司、荆、北雍、东益、宁、交、广、北并、北冀、梁、徐、北兖等十七州，及幽、冀、东秦、青、并、兖、秦、雍等侨州，共二十五州。
东晋的统治区袭承西晋，虽然也是实行州、郡、县三级制，但是其州郡越分越多，从而导致辖区缩小。
西晋末年，大量流民南渡。
东晋朝廷为了安抚侨民及侨姓世族，以原籍州郡县名寄治别处，而无实地，此即侨州郡县。
等到安定后实施土断，使其州郡领有实地，户籍和赋役与一般州郡县相同。
东晋沿袭西晋军事制度，但已有变化。
军事上，因为皇权衰微，中军往往有名无实，同驻京师的还有扬州都督所属军队。
外军大多由世族的军队组成，统军将领称霸一方，其中荆州军甚至超越中央。
东晋多次北伐，确有助于巩固偏安之局，但如果方镇具有野心，往往藉此篡位。
关于兵源方面，因为战乱军户大减，兵员改以募兵补充，或直接征兵。
其中，由北方流民招募组成的北府兵，屡次击败强敌，在东晋后期等级如同中军。
政治上，东晋朝廷逐渐形成了门阀制度，地方设立侨置州郡。
经济上，东晋劝课农桑、出现庄园经济，江南得到了初步的开发。
然而，汉末三国以来土地兼并的情况，到了东晋时期却是愈演愈烈。
赋税上，在淝水之战后，东晋基本恢复了西晋的户调之式。
谢安的王公以下都要交税，而在役者可以免交的制度被改变了。
由此可以见到，人们把役、调对举，服役者不能免调，输调者不能免役。
《晋书·范宁传》所记便有“举召役、调，皆相资须”之言。
所谓“皆相资须”，即役、调都得承担。
闻人奭也有“百姓单贫，役、调深刻”之言（《晋书·会稽文孝王道子传》），百姓是既要交税，又要服役，从而出现了“流瑾不绝”的现象，王公贵族却是从来不服役的。
淝水之战前要纳税，而战后，也看不到有关他们纳税的规定。
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南朝有所谓“复士”，推其源当始于淝水之战。
淝水之战后，亲属虽不可荫，世族公卿本人却重新变成了可以享受免税特权的阶层。
这又是镇之以静方针被破坏的表现。